С 2006 года храм является представительством Крестовоздвиженского Иерусалимского женского ставропигиального монастыря. С ноября 2008 года при храме действует православный творческо-просветительский центр «Купель». На приходе открыта библиотека, действует воскресная школа, проводятся тематические беседы.
В 1812 году здесь перед советом в Филях молился Михаил Илларионович Кутузов. Троицкая церковь не только уцелела в годы гонений, но и никогда не закрывалась. Божиим промыслом сохранился старинный интерьер.
К началу 1990-х годов на храме не оставалось ни куполов, ни кровли. Подъездов, подходов к храму не было. Первое время священник ходил от станции Бутово пешком по полю. Это занимало около полутора часов. У храма в железной будке переодевался и служил под открытым небом. Затем также шел обратно.
Первая каменная церковь на месте ныне существующего храма Троицы Живоначальной на Грязех была построена в середине XVII века и неоднократно перестраивалась. Храм, сохранившийся до настоящего времени, возведен в 1857-1868 годах по проекту архитектора М.Д. Быковского.
Настоятель – протоиерей Иоанн Кудрявцев. Священник окормляет насельников Боткинской больницы. Те, кто может ходить, сами с удовольствием идут в храм, чтобы принять участие в богослужении и разделить радость общей молитвы. Если больной не может встать, отец-настоятель сам приходит к недужному - поисповедовать и причастить страдальца Святых Христовых Таин.
По преданию, церковь была построена на том месте, где когда-то стояла палатка московского первосвятителя, откуда подвижник наблюдал за строительством Спасо-Андроникова монастыря, основанного по его обету в 1361 году за чудесное спасение во время шторма.
Здесь располагается православный приход храма Рождества Пресвятой Богородицы во Владыкине Московской епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат).
По указу царя Василия Ивановича Шуйского 26 мая 1609 года Свято-Троицкой Сергиевой Лавре был пожалован земельный участок на берегу реки Неглинной в память героического стояния Лавры за веру и Отечество в Смутное время.
Из истории одного из самых знаменитых соборов Москвы мы узнаем, что между 1774-м и 1793 годами перед входом в храм было возведено небольшое здание для Богоявленского народного училища, сохранившееся до настоящего времени.
Троице-Одигитриевская Зосимова пустынь была третьей женской общежительной обителью (после Аносиной Борисоглебской и Спасо-Бородинской), благословленной в 1820-х годах и затем утвержденной на земле Московской епархии великим ее архипастырем святителем Филаретом Московским. Основание же общине положили схимонах и пустынножитель преподобный Зосима (Верховский) с девицами и вдовицами, предавшимися под его духовное окормление.